A IPB comumente atua na plena integração dos membros da Igreja por meio das sociedades internas que são organizadas de acordo com critérios de sexo e idade e atuam sob a supervisão, orientação e superintendência do Conselho, com o qual se relacionam por meio de um conselheiro nomeado anualmente.

Entre os objetivos das sociedades internas, estão a promoção de integração dos membros da Igreja, por meio de treinamento na vida cristã e na dinâmica denominacional, em todos os seus aspectos, o incentivo e o cultivo sadio das atividades espirituais, evangelísticas, missionárias, culturais, artísticas, sociais e desportivas, a cooperação com a Igreja, como parte integrante dela e o serviço a Deus e ao próximo.

Além das sociedades, as igrejas locais também podem contar com grupos e ministérios organizados para determinados fins.

As sociedades e ministérios atuais da IPD são:

Sociedades (por ordem de organização)

• SAF – Sociedade Auxiliadora Feminina – organizada em 17 de setembro de 1967.
• UMP – União de Mocidade Presbiteriana – organizada em 21 de fevereiro de 1968.
• UPH – União Presbiteriana de Homens, organizada em 14 de setembro de 1969.
• UPA – União Presbiteriana de Adolescentes – organizada em 9 de março de 1986.
• UCP – União de Crianças Presbiterianas – organizada em 5 de dezembro de 1971.

Outros Ministérios

• Ministério Barnabé: organizado em 2012, trata-se de um trabalho social voltado ao auxílio e pregação do Evangelho para pessoas em situação de rua.
• Ministério de Casais: organizado em 2013, tem como objetivo o ensino, a edificação e o apoio às famílias, com foco nos casais noivos e casados da IPD.

Corais e conjuntos

• Coral Betel – membros IPD (organizado em novembro de 1967).
• Conjunto Louvor & Vida – mulheres (organizado em julho de 1997).
• Coral Louvor para Cristo – crianças e adolescentes (organizado em agosto de 2009)
• Conjunto Luz do Mundo – adolescentes (organizado em agosto de 2018).
• Coral Jovem – jovens (organizado em fevereiro de 2019).

Grupos musicais

• Renova – grupo de louvor (organizado entre 1997/1998).
• Cháris – grupo de louvor (organizado em maio de 2017).
• Doūlos – grupo de louvor (organizado em agosto de 2018).